1. Какой именно пакет не ставится? ShopModxBox?
  2. Call to undefined method modNamespace_mysql::getCorePath() Этого вообще не должно быть в нашем modxSmarty, и как раз это очень даже возможно из-за неправильной кодировки (подобное уже бывало). Кодировка везде должна быть utf-8.